The Organization has a President and three Vice-Presidents who preside over Congress and of the Executive Council. The Secretariat, headquartered in Geneva, is headed by the Secretary-General.

Le Congrès météorologique mondial est l'organe suprême de l'OMM. Ses décisions sont appliquées par le Conseil exécutif, tandis que six conseils régionaux sont responsables de la coordination des activités météorologiques, hydrologiques et connexes dans leurs régions respectives.
The Organization has a President and three Vice-Presidents who preside over Congress and of the Executive Council. The Secretariat, headquartered in Geneva, is headed by the Secretary-General.
Le Congrès météorologique mondial réunit tous les quatre ans les représentants des pays Membres pour:
Les fonctions du Président et du Secrétaire général de l’Organisation sont définies dans le Règlement général de l’OMM. Ce dernier figure dans le Recueil des documents fondamentaux N° 1 (OMM-N° 15), qui contient également les textes suivants: Convention de l’Organisation météorologique mondiale; Statut du personnel; Règlement financier; accord entre l'Organisation des Nations Unies et l’Organisation météorologique mondiale; Convention sur les privilèges et immunités des institutions spécialisées; et texte authentique de l’accord, de l’arrangement d'exécution et du protocole conclus entre le Conseil fédéral suisse et l’Organisation météorologique mondiale pour régler le statut juridique de cette organisation en Suisse.
Le Conseil exécutif est l’organe exécutif de l’OMM, qui applique les décisions du Congrès. Il coordonne les programmes, gère le budget, examine les résolutions et recommandations des conseils régionaux et des commissions techniques et se prononce sur la suite à leur donner, et étudie toute question intéressant la météorologie internationale et les disciplines connexes et fait des recommandations à cet égard.
Le Conseil exécutif tient normalement une session au moins une fois par an, en un lieu et à une date fixés par le Président de l’Organisation, après consultation des membres du Conseil. Les décisions requièrent une majorité des deux tiers.
Il comprend le Président, les trois Vice-présidents, les présidents des six conseils régionaux et 27 directeurs de Services météorologiques ou hydrométéorologiques nationaux, élus par le Congrès. Chaque membre dispose d'une seule voix.
Six conseils régionaux sont responsables de la coordination des activités météorologiques, hydrologiques et connexes dans leurs régions respectives, à savoir :
Ils tiennent dans leurs régions respectives une réunion tous les quatre ans au cours de laquelle ils élisent un président et un vice-président. Le président de chaque conseil régional est membre de droit du Conseil exécutif.
Huit commissions techniques cèdent la place à deux commissions techniques suite à l'approbation, par le Dix-huitième Congrès météorologique mondial (juin 2019), d'une réforme portant sur la gouvernance des organes consituants de l'OMM. Le Comité de coordination technique relevant du Conseil exécutif assurera la liaison entre ce dernier et les commisions techniques, le Conseil de la recherche et les autres organes compétents.
Both the World Meteorological Congress and Exective Council have created advisory and coordination bodies to streamline the work of the Organization and decision-making. These include the Technical Coordination Committee, Policy Advisory Committee (PAC), Scientific Advisory Panel (SAP), Joint WMO-IOC Collaborative Board and several panels.